Circname | osa-circ2995-OS01T0679900 |
---|---|
circID | 1:27984048-27985051_+ |
gene | OS01T0679900 |
isoform | OS01T0679900-01 |
stress | cold |
tissue | multipleTissue(unclarified tissue) |
chr | 1 |
width | 1004 |
detection_score | 1.32 |
stress_detection_score | 7.273 |
start_anno | exon,CDS |
end_anno | exon, |
algorithm | CIRCexplorer2 |
splicedSeq | GTATCCTTCTCACTCGTTCTACGGAGCGCGCCGAATCCCCCGCCCTCTGCTATTTGAGGGGGGTGGATCTGATGTGTGTGCTTGCTGGTGTTCCGGTGCATGTTTTCGCTGTCGATCAATGGGATTTCTCGATGTTTTTGGAGCTACTTTAGATTTTGAATGGTGGTGAGTTTGGTGGTTCTGATCCCATTGTTCCTTCCTCTAGAGTTTGCTGATACATGGGGAAGTACTAGTACTTTTTTGTTGGATCGAAATTCTCGATTTTGTCTTTTACTCTTGTTCAGTAAAAGTTATGGTTATGATGATCGGCGCGTGCTTCTTTTCTCGCTGTTTTTTTTTTAGAAATATCGGCGTGGCATCTACTAGTTCTAGTTGTGTTCATCCCAGCTTTGTTAGTCGAAAAAAACTTTTGGTTTTACTCAAGTTTCCAATTTCTTTTTGTTGAAAAAAAAACTTTGCCTCATCCAAAGGTTATTATTATTTCTTAATCGCGATCACTATTTAGAAAAATATTATATCGAATTTATCACGGGATTATAGTCGCTTCCATAGGCTTTGATCAAAACTTTGATCCATTTCAATCTCGATATTATTGAGTTTTGCCGGCCTATCATGTGCCTCTATTATTAGGATTTTGAGAGATGGTGAGAGCCGAGCCAACTCCCATTTACGCGGCAGGTGGTACACCAATTATTTGGTTTCTCTGTGTCCATGGACTTGCTTAGTCTCAACGGTTAGGCCTGGACGTCTGGTGTGGTGCTGCAGGCCGCACCTCCTAATCTCCCCTTAATCTCAACTCCTTGGCCAGCCTCGTGTTCGTGCTTAATCAAATGATCCCTGTTTATTTTTCAGATCTGTTAATCTCATGAGTTCTTGAAAGGGCAATTATTAGCTGAGCATGATTGAACTAGGGAATTGTTTATTTGTCATTCTGGCGTGGTTGGCTTACTTTATTGCTCACTCATGGACAACGACCTTTTTCAATTTGTTTTGCGATCCTTGA |
predAA | - |
miRNA | osa-miR1428a-3p |
superCircRNARegion | 1:27983688-27985051_+ |
crop | rice |
strand | + |
start | 27984048 |
end | 27985051 |
seq | GTATCCTTCTCACTCGTTCTACGGAGCGCGCCGAATCCCCCGCCCTCTGCTATTTGAGGGGGGTGGATCTGATGTGTGTGCTTGCTGGTGTTCCGGTGCATGTTTTCGCTGTCGATCAATGGGATTTCTCGATGTTTTTGGAGCTACTTTAGATTTTGAATGGTGGTGAGTTTGGTGGTTCTGATCCCATTGTTCCTTCCTCTAGAGTTTGCTGATACATGGGGAAGTACTAGTACTTTTTTGTTGGATCGAAATTCTCGATTTTGTCTTTTACTCTTGTTCAGTAAAAGTTATGGTTATGATGATCGGCGCGTGCTTCTTTTCTCGCTGTTTTTTTTTTAGAAATATCGGCGTGGCATCTACTAGTTCTAGTTGTGTTCATCCCAGCTTTGTTAGTCGAAAAAAACTTTTGGTTTTACTCAAGTTTCCAATTTCTTTTTGTTGAAAAAAAAACTTTGCCTCATCCAAAGGTTATTATTATTTCTTAATCGCGATCACTATTTAGAAAAATATTATATCGAATTTATCACGGGATTATAGTCGCTTCCATAGGCTTTGATCAAAACTTTGATCCATTTCAATCTCGATATTATTGAGTTTTGCCGGCCTATCATGTGCCTCTATTATTAGGATTTTGAGAGATGGTGAGAGCCGAGCCAACTCCCATTTACGCGGCAGGTGGTACACCAATTATTTGGTTTCTCTGTGTCCATGGACTTGCTTAGTCTCAACGGTTAGGCCTGGACGTCTGGTGTGGTGCTGCAGGCCGCACCTCCTAATCTCCCCTTAATCTCAACTCCTTGGCCAGCCTCGTGTTCGTGCTTAATCAAATGATCCCTGTTTATTTTTCAGATCTGTTAATCTCATGAGTTCTTGAAAGGGCAATTATTAGCTGAGCATGATTGAACTAGGGAATTGTTTATTTGTCATTCTGGCGTGGTTGGCTTACTTTATTGCTCACTCATGGACAACGACCTTTTTCAATTTGTTTTGCGATCCTTGA |