Circname | osa-circ41657-OS01T0938900 |
---|---|
circID | 1:41215423-41216205_+ |
gene | OS01T0938900 |
isoform | OS01T0938900-01 |
stress | cold |
tissue | multipleTissue(unclarified tissue) |
chr | 1 |
width | 783 |
detection_score | 0.33 |
stress_detection_score | 1.818 |
start_anno | exon,CDS |
end_anno | intron |
algorithm | CIRCexplorer2 |
splicedSeq | GTGTGTTGGAATCCATTTTAGTTATTGTAATATAAAGGATAGATATATCAGGTGGCTGCCCATTCTCTGGTTGTCGCATGAAACATCTCTCTATTTCTTTAATCTATAATTCATTTATTGAAGCGATGGATATTTATGGAGCGCAAAATAGTTTTTTTTGTAGTTAACTGATTTGCTACCTTCAGTTCCATTTTGCAAATATTCTATTCTTTCCATACTAGAACTATGACTTTTGTTGTTTTAATTCTTCTTTTGTCATGTTATGTTCTTGTTCTTTTAAACTTATTCATGCTTCCCTGAATTGTCAGTGTGAGCCATCTGCATTAAAAATTTATTCACATGCTATACTGTGATAGCACCGTTAGGTCTTGTTTTGATACATAAGAATTTCAATTACCATGGCCATCTCCCACTTTCCAAACAGGGCCTTATTGGTACAGGATGAATGCTTGAACAGATCTTGGTTAAGAATATACTGATAATCTTGGTGGAGCTTGCTAGATGTATTGTATATAATATCATAAGTGATACCATATTTGTTTCACTAGGAGTTTAGTATTTGTGCCTTTGATGTCAGGCCAATCTAAGAGGATATATAGTTCACAGTTCAAATTTACAATTATAAATCCCCAACCAAGAACTGTTATCATTAGAACCCAATTTCTGTTTCACGGTTACTCGAAAACAGTCAAAGGCTTCAGAAAAACTATACTTCTATGTGGTATTGTAGACTTACTGTCCAGTGTTTGCTACTTACTGTCCAGTGTTTGCTAAATGCTGAT |
predAA | - |
miRNA | osa-miR2920 |
superCircRNARegion | 1:41214333-41216707_+ |
crop | rice |
strand | + |
start | 41215423 |
end | 41216205 |
seq | GTGTGTTGGAATCCATTTTAGTTATTGTAATATAAAGGATAGATATATCAGGTGGCTGCCCATTCTCTGGTTGTCGCATGAAACATCTCTCTATTTCTTTAATCTATAATTCATTTATTGAAGCGATGGATATTTATGGAGCGCAAAATAGTTTTTTTTGTAGTTAACTGATTTGCTACCTTCAGTTCCATTTTGCAAATATTCTATTCTTTCCATACTAGAACTATGACTTTTGTTGTTTTAATTCTTCTTTTGTCATGTTATGTTCTTGTTCTTTTAAACTTATTCATGCTTCCCTGAATTGTCAGTGTGAGCCATCTGCATTAAAAATTTATTCACATGCTATACTGTGATAGCACCGTTAGGTCTTGTTTTGATACATAAGAATTTCAATTACCATGGCCATCTCCCACTTTCCAAACAGGGCCTTATTGGTACAGGATGAATGCTTGAACAGATCTTGGTTAAGAATATACTGATAATCTTGGTGGAGCTTGCTAGATGTATTGTATATAATATCATAAGTGATACCATATTTGTTTCACTAGGAGTTTAGTATTTGTGCCTTTGATGTCAGGCCAATCTAAGAGGATATATAGTTCACAGTTCAAATTTACAATTATAAATCCCCAACCAAGAACTGTTATCATTAGAACCCAATTTCTGTTTCACGGTTACTCGAAAACAGTCAAAGGCTTCAGAAAAACTATACTTCTATGTGGTATTGTAGACTTACTGTCCAGTGTTTGCTACTTACTGTCCAGTGTTTGCTAAATGCTGAT |