Circname | osa-circ40607-OS03T0198300 |
---|---|
circID | 3:5165842-5166218_+ |
gene | OS03T0198300 |
isoform | OS03T0198300-01 |
stress | - |
tissue | multipleTissue(unclarified tissue) |
chr | 3 |
width | 377 |
detection_score | 0.33 |
stress_detection_score | - |
start_anno | exon,CDS |
end_anno | intron |
algorithm | CIRCexplorer2 |
splicedSeq | GTACTCTGGATTTATCCCAAATATTTTTTTCTGATTGACAATGAGTTGATGGCAAAAAATTTGTGAAGTTTATGGTATAGTTTTGTAGCAGATCTGGTATCATGTTGTTTTACTGAGGTTTCGTTTTGTGTTTTTTCCCTTATGGAATTATGCTAATGTAGAAGTGGTCCTCAGAATTATCTCAAATGCTATCCATTAAAAGTCACTAACAGCCAAGTTTTAAGCTTGTACCTATTTGGATATTAAACGGATTGCAGGTGTTATTTCTCCTTTTCAAGTTGATTTTCTTACAATGTAAAACACCTCGTGTGATTCTTGTGGTTCTCATTGAGAGTCGAGACAGTGAAAAAAATCAGGATTTTTGTAAAATAATTTA |
predAA | - |
miRNA | - |
superCircRNARegion | 3:5164831-5166218_+ |
crop | rice |
strand | + |
start | 5165842 |
end | 5166218 |
seq | GTACTCTGGATTTATCCCAAATATTTTTTTCTGATTGACAATGAGTTGATGGCAAAAAATTTGTGAAGTTTATGGTATAGTTTTGTAGCAGATCTGGTATCATGTTGTTTTACTGAGGTTTCGTTTTGTGTTTTTTCCCTTATGGAATTATGCTAATGTAGAAGTGGTCCTCAGAATTATCTCAAATGCTATCCATTAAAAGTCACTAACAGCCAAGTTTTAAGCTTGTACCTATTTGGATATTAAACGGATTGCAGGTGTTATTTCTCCTTTTCAAGTTGATTTTCTTACAATGTAAAACACCTCGTGTGATTCTTGTGGTTCTCATTGAGAGTCGAGACAGTGAAAAAAATCAGGATTTTTGTAAAATAATTTA |