Circname osa-circ41310-OS03T0116800
circID 3:948003-948458_+
gene OS03T0116800
isoform OS03T0116800-01
stress cold
tissue multipleTissue(unclarified tissue)
chr 3
width 456
detection_score 0.33
stress_detection_score 1.818
start_anno exon,CDS
end_anno intron
algorithm CIRCexplorer2
splicedSeq
GTAAGTTCTTCTCAATGTTTAGCCTACTTATGTTGATTGGTCACCTTATATTTGCTGCTATAGTTTTGTTCAACAAATATTGAGGATGGCAAGAATCCTTTTTACGAAAAATCAGCATGACAAACCATGCAAATTTAGAGAGTCAACATATCGGCACTCTGGCTTGGAGTAGGGTACACATCTTTACTGGTTTTACTGCACCTTAAAGAGCAGAATTGTGCACATCAGAGTCATATTTCTATGCAATCGTAATTGCATTGCAATTTTGCTGTTACACTTTATCTGGTGGCATATGACGTTTTTTTTGCTTATGCTTGTATGCTTCAGGATGTAGGATGTGCATTTGTGCATAATGTTGGCATAACTATGAAAACATGAAAGTTTATCTCTGCAGTAGAGTTTTCTTTGCATATGCACTTGAAAATTTCCTTGAATATGGACAGTACAGATGCTTA
predAA
-
miRNA -
superCircRNARegion -
crop rice
strand +
start 948003
end 948458
seq
GTAAGTTCTTCTCAATGTTTAGCCTACTTATGTTGATTGGTCACCTTATATTTGCTGCTATAGTTTTGTTCAACAAATATTGAGGATGGCAAGAATCCTTTTTACGAAAAATCAGCATGACAAACCATGCAAATTTAGAGAGTCAACATATCGGCACTCTGGCTTGGAGTAGGGTACACATCTTTACTGGTTTTACTGCACCTTAAAGAGCAGAATTGTGCACATCAGAGTCATATTTCTATGCAATCGTAATTGCATTGCAATTTTGCTGTTACACTTTATCTGGTGGCATATGACGTTTTTTTTGCTTATGCTTGTATGCTTCAGGATGTAGGATGTGCATTTGTGCATAATGTTGGCATAACTATGAAAACATGAAAGTTTATCTCTGCAGTAGAGTTTTCTTTGCATATGCACTTGAAAATTTCCTTGAATATGGACAGTACAGATGCTTA