Circname | osa-circ39488-OS08T0300200 |
---|---|
circID | 8:12334234-12335363_- |
gene | OS08T0300200 |
isoform | OS08T0300200-02 |
stress | salt |
tissue | multipleTissue(unclarified tissue) |
chr | 8 |
width | 1130 |
detection_score | 0.33 |
stress_detection_score | 3.448 |
start_anno | exon, |
end_anno | exon, |
algorithm | CIRCexplorer2 |
splicedSeq | GAGTTTCAATTTTGGATAGTGATAGTTCTGGTATCACTATGGAGCTTGAGTTGCAATGGGATGGCAATCCAAATATAGTACTGGACATTCAAACAACACTTGGAATCTCACTTCCTGTGCAGTGAAAAATATTGGATTCACAGGAGTACTTCGCTTAGTTTTTAAGCCTCTGGTTGCAGAACTGCCTTGCTTTGGAGCTGTTTGCTGTTCTTTGAGAGAGAA |
predAA | - |
miRNA | - |
superCircRNARegion | 8:12333922-12338731_- |
crop | rice |
strand | - |
start | 12334234 |
end | 12335363 |
seq | GAGTTTCAATTTTGGATAGTGATAGTTCTGGTATCACTATGGAGCTTGAGTTGCAATGGGATGGCAATCCAAATATAGTACTGGACATTCAAACAACACTTGGAATCTCACTTCCTGTGCAGGTAACTCGTAATTTTTGTAACATGACCTAAAACAATGGTTATATGTAAAACTGCTGTACAAAATATAGTGTGGAAACAATTTTTTTGTTATATTTATTTATTAGTGTTCTGTTCTTTTGAACATCTTAGATAGAAAACCACATTCAACTTCATCTCCTGTTTGCTTTATGTTTAACTCAATTAATAAGACAGCTGTTTCTGATATTGTTTTTAATAGTAACTAAGGTACTGAGTGAGTGATTAATACGGGGTACTACACTATCGTAGAACATCATGATTTTATGATCTACATTTTGCATGATAAATGAACAACTTTTACTATTGTAGAGTATATTGGAACTAAGGATTTGATTAAACAAATTTGTTGGTGATTTATGTTGGGATTTTATTGACTAGTTTGCAATTGGTGAACAAATTTGTTACTCTGATTCAGTGATTTACTAGTTTTGCATGTTTCAGTTTTCAAATTTCCTCTTTTGAAATATTTCAACCTACAAAAGGAGCTTCTGAATAATAACTGTTTCAGCTTCTACTCCAGTTTTAGTTGCTCATTTGTTATTTTGAGAATGTGGAGTGAGACCATTTTATGTTAAAAAAAAATATGGTTATGCCTAGAAAATGAATTGTAAAGAATCTATTTTCATGTAATTTCATTTGGCTGTATGTAGAGACTTTTGTGTCAATTTATGATCTGGATAAGGTAAACATAATTACCTGAAGAGGGTAATTGAGGCTTCATTTACTATTGTGTCATGTTATACGTATTTTGTCATACAACTAGTGTTCCTTAGATCATGATGTATATGCTATACTAATCTTGTCATATGACTAGTTTTCCTTAGATCAGTGTGTGACCATGTATAAAATTCCAAGAGACTAATTTTAAAATGTCTGTCCTATATTTAGGTGAAAAATATTGGATTCACAGGAGTACTTCGCTTAGTTTTTAAGCCTCTGGTTGCAGAACTGCCTTGCTTTGGAGCTGTTTGCTGTTCTTTGAGAGAGAA |