Circname | osa-circ39464-OS08T0192900 |
---|---|
circID | 8:5424854-5425793_- |
gene | OS08T0192900 |
isoform | OS08T0192900-01 |
stress | salt |
tissue | multipleTissue(unclarified tissue) |
chr | 8 |
width | 940 |
detection_score | 0.33 |
stress_detection_score | 3.448 |
start_anno | exon,CDS |
end_anno | exon,CDS |
algorithm | CIRCexplorer2 |
splicedSeq | GATGCTAAGCCTGCGGATCCGGTTGCTAATAATGGTCTTAAGAAAGGCAAGCCAGCGAGCAGCGATTCTGAGAGTGATTCAGACGATGAAATGGATGAGGACGAGGTTCGCATTTCATTTCTGTTTGGATATGTTTCACTTATGTAGTTTTATGTTAATGATTGTGATGCTCATGCTAGGTAGTTAGATTACAGTGGTTCTTTTTAACAGTATATTAAACATGCGACATTTCAAAGGGAACTGATCAACCTTTTGTTTTAGCTTGTTTGACATTGTTTCTATGTTCTTTTGTTCATCCTTCAGAAACCTGCTGCTCCAGTGAAAAAAACTTCTGTGACTGCACAAAAGAAAAAAGATGATTCTGACAGCTCTGAGAGTGAGTCAGATGAGAGTGATTCGGACGAGGTGAGTGCTTAGAGATGACTGGATGAATTCCTTTGCTGTTTTTATAGTTGTACTTACACTTGTATCTTTGGTTATATTCCTTGTAAATGTTAATGGACATATTTTTCATGGCATAGCTGACAGTATTTGATTATATTTTTCAGGATGTGCCTACAAAGTCTAAAGCCCCTGCTGTAGCTGCCAAGAATGATGATTCTACTGATGGTTCCGAGTCCGAAAGTGACTCTGAGGATGAGGTATTCCTTGGACTAGTATGTCTAATATGGTTCCATTGTTAAGTGTAACAACTAATGTCTAATATGGTTCCATTGTTAAGTGTTAACTCCATTTATATTTGTCAACTATTTAGGAGAAAGCTAAGAAACCTACCCTACCTGCCAATAGTTCTTTGTTTACATGCCTATCTGACACTCCTTTTGCCTCACAGGATGCTGCACCCAAGGGTGCTGCCAAGAAGGAAAGCAGCAGTGATGAAGAGGATGACAGTTCTGAGGAAAGCTCTGATGATGAACCTAAACAACCTCAACAAAAAAA |
predAA | - |
miRNA | osa-miR169i-3p |
superCircRNARegion | 8:5423488-5425956_- |
crop | rice |
strand | - |
start | 5424854 |
end | 5425793 |
seq | GATGCTAAGCCTGCGGATCCGGTTGCTAATAATGGTCTTAAGAAAGGCAAGCCAGCGAGCAGCGATTCTGAGAGTGATTCAGACGATGAAATGGATGAGGACGAGGTTCGCATTTCATTTCTGTTTGGATATGTTTCACTTATGTAGTTTTATGTTAATGATTGTGATGCTCATGCTAGGTAGTTAGATTACAGTGGTTCTTTTTAACAGTATATTAAACATGCGACATTTCAAAGGGAACTGATCAACCTTTTGTTTTAGCTTGTTTGACATTGTTTCTATGTTCTTTTGTTCATCCTTCAGAAACCTGCTGCTCCAGTGAAAAAAACTTCTGTGACTGCACAAAAGAAAAAAGATGATTCTGACAGCTCTGAGAGTGAGTCAGATGAGAGTGATTCGGACGAGGTGAGTGCTTAGAGATGACTGGATGAATTCCTTTGCTGTTTTTATAGTTGTACTTACACTTGTATCTTTGGTTATATTCCTTGTAAATGTTAATGGACATATTTTTCATGGCATAGCTGACAGTATTTGATTATATTTTTCAGGATGTGCCTACAAAGTCTAAAGCCCCTGCTGTAGCTGCCAAGAATGATGATTCTACTGATGGTTCCGAGTCCGAAAGTGACTCTGAGGATGAGGTATTCCTTGGACTAGTATGTCTAATATGGTTCCATTGTTAAGTGTAACAACTAATGTCTAATATGGTTCCATTGTTAAGTGTTAACTCCATTTATATTTGTCAACTATTTAGGAGAAAGCTAAGAAACCTACCCTACCTGCCAATAGTTCTTTGTTTACATGCCTATCTGACACTCCTTTTGCCTCACAGGATGCTGCACCCAAGGGTGCTGCCAAGAAGGAAAGCAGCAGTGATGAAGAGGATGACAGTTCTGAGGAAAGCTCTGATGATGAACCTAAACAACCTCAACAAAAAAA |