Circname | osa-circ43251-OS08T0116500 |
---|---|
circID | 8:904616-905109_+ |
gene | OS08T0116500 |
isoform | OS08T0116500-01 |
stress | cold |
tissue | multipleTissue(unclarified tissue) |
chr | 8 |
width | 494 |
detection_score | 0.33 |
stress_detection_score | 1.818 |
start_anno | exon,CDS |
end_anno | intron |
algorithm | CIRCexplorer2 |
splicedSeq | GTAAAACCTCCCGGCCCCTTGTCCCCTGCCTCCTTGCTATGCCACTGCGTGATTGTCGATGTAGATTTGATTGAACCTAGTTTATCTCATGAGGGAAATTACCATAGATTTATATAGGGTTTGTCATGAAGATGTAATCCTATTAGTTGGTTGCTTCGGTTAACCTTTGTGCAATTTAGTAATTGTAGTTATACATCTGTTATCTCATGAACATTGCGATTGCCATCGGAATTATATAGTTTGGTGTAGATTATTACAACTTAGTTACTAGTTATGCCGTGGAATTGTCTTGATCATGTGTTCTATTCTAATCGTGTCAATGTTGTTTGGAAGTTAAAAGCTGTTTTGAGCTGTTGTCATGTTTCATCTTTGCCATATTTAACTAGGAAACTTGAGCATGTCAATTCTGTTAATATTATGTTGTGTATGAGTTCTGGTTCTAGGATTACTTGTTTCATTCTGTTAATAAATCGTTATATACATGTTTGTGATC |
predAA | - |
miRNA | - |
superCircRNARegion | 8:904128-905241_+ |
crop | rice |
strand | + |
start | 904616 |
end | 905109 |
seq | GTAAAACCTCCCGGCCCCTTGTCCCCTGCCTCCTTGCTATGCCACTGCGTGATTGTCGATGTAGATTTGATTGAACCTAGTTTATCTCATGAGGGAAATTACCATAGATTTATATAGGGTTTGTCATGAAGATGTAATCCTATTAGTTGGTTGCTTCGGTTAACCTTTGTGCAATTTAGTAATTGTAGTTATACATCTGTTATCTCATGAACATTGCGATTGCCATCGGAATTATATAGTTTGGTGTAGATTATTACAACTTAGTTACTAGTTATGCCGTGGAATTGTCTTGATCATGTGTTCTATTCTAATCGTGTCAATGTTGTTTGGAAGTTAAAAGCTGTTTTGAGCTGTTGTCATGTTTCATCTTTGCCATATTTAACTAGGAAACTTGAGCATGTCAATTCTGTTAATATTATGTTGTGTATGAGTTCTGGTTCTAGGATTACTTGTTTCATTCTGTTAATAAATCGTTATATACATGTTTGTGATC |